Коллекция Музея МАНИ – уникальное собрание, сфомированное внутри Московской концептуальной школы в 1988-1991 года. Инициатором его создания стал один из основателей группы "Коллективные действия" художник Николай Панитков, он же являлся и главным хранителем Музея МАНИ до 2004 года. В создании коллекции приняли активное участие все значительные авторы Московской концептуальной школы.

К началу 90-х годов был сформирован основной костяк коллекции, ее стержень, состоящий более чем из 350-ти единиц хранения. Все произведения хранились на даче у Николая Паниткова, в тоже время было организовано несколько значимых выставок, на которых экспонировались произведения из коллекции МАНИ.

В начале 2000-х гг. резко встал вопрос о состоянии сохранности произведений, о невозможности организовать музейные условия для их хранения. С 2004 года Е.К.АртБюро приняло на себя обязанности по администрированию всей коллекции, в частности, представляло коллекцию МАНИ на выставках в России, Бельгии, Германии, Испании и Великобритании. Одновременно с администрированием ведется работа по каталогизации, изучению, реставрации, экспонированию и публикации коллекции МАНИ.

В 2015 году Музей МАНИ был официально зарегистрирован как Некоммерческое негосударственное частное учреждение культуры «Музей МАНИ».

Музей МАНИ предоставляет работы собрания на различные выставки в стране и за рубежом.